在合成生物學(xué)中,無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)是構(gòu)建人工細(xì)胞和基因電路的he xin工具。研究人員通過混合不同物種(如大腸桿菌+哺乳動(dòng)物)的裂解物,創(chuàng)建雜合翻譯系統(tǒng),以實(shí)現(xiàn)跨物種蛋白的協(xié)同合成。該技術(shù)還支持無細(xì)胞基因線路的快速原型設(shè)計(jì),例如將CRISPR組分與報(bào)告蛋白共表達(dá),用于體外診斷工具的開發(fā)。由于擺脫了細(xì)胞膜的限制,CFPS可直接整合非生物元件(如合成聚合物或納米材料),推動(dòng)人工合成生命和生物-非生物雜合系統(tǒng)的前沿研究。無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)可快速表達(dá)膜蛋白(如GPCRs、離子通道)用于藥物靶點(diǎn)研究,解決了此類蛋白在細(xì)胞內(nèi)難表達(dá)、易沉淀的問題。在診斷領(lǐng)域,基于CFPS的體外轉(zhuǎn)錄-翻譯系統(tǒng)被整合到便攜式設(shè)備中,用于現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)病原體核酸(如埃博拉病毒),實(shí)現(xiàn)“樣本進(jìn)-結(jié)果出”的快速診斷。此外,該技術(shù)還能合成定制化抗原,用于抗體庫(kù)篩選或個(gè)性化cancer疫苗開發(fā)。芯片級(jí)體外蛋白表達(dá)平臺(tái)在個(gè)性化醫(yī)療中尤為關(guān)鍵,能夠幫助指導(dǎo)靶向藥物選擇。目的蛋白表達(dá)水平
將體外蛋白表達(dá)推向規(guī)?;a(chǎn)需解決三大he xin瓶頸:裂解物制備標(biāo)準(zhǔn)化問題:不同批次細(xì)胞破碎效率差異導(dǎo)致核酸酶/蛋白酶殘留量波動(dòng)(CV>15%),造成翻譯活性離散度超20%。能量再生持續(xù)性不足:即使采用多酶耦聯(lián)再生系統(tǒng)(如pyruvate kinase,PK-肌激酶級(jí)聯(lián)),ATP濃度常在反應(yīng)啟動(dòng)6小時(shí)后衰減至閾值(<1 mM)以下,大幅限制長(zhǎng)時(shí)程蛋白表達(dá)效率。產(chǎn)物濃度天花板效應(yīng):受限于核糖體組裝速率(約10個(gè)核糖體/分鐘/條mRNA),當(dāng)前比較高產(chǎn)量只達(dá)5-8 g/L,較CHO細(xì)胞灌注培養(yǎng)系統(tǒng)(>10 g/L)仍有明顯差距。為突破這些限制,前沿策略聚焦于 工程化裂解物開發(fā)—通過CRISPR敲除宿主核酸酶基因(如RNase E)并將關(guān)鍵翻譯因子過表達(dá)100倍以上,使體外蛋白表達(dá)系統(tǒng)的批間穩(wěn)定性提升至CV<5%,ATP維持時(shí)間延長(zhǎng)至24小時(shí)以上,明顯提升了工業(yè)轉(zhuǎn)化潛力。gst蛋白表達(dá)濃度??兔網(wǎng)織紅細(xì)胞裂解物??(RRL)和??小麥胚芽裂解物??(WGE)是兩類常見真核平臺(tái),用于體外蛋白表達(dá).
相較于原核表達(dá)體系,真核體外蛋白表達(dá)的he xin優(yōu)勢(shì)在于具備部分翻譯后修飾能力,但 關(guān)鍵修飾途徑仍存在明顯局限。在缺乏內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制的情況下,糖基化修飾通常終止于高甘露糖型(Man?GlcNAc?)階段,無法合成復(fù)雜雙觸角唾液酸化糖鏈。這一缺陷直接影響zhi liao性抗體的抗體依賴性細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒性(ADCC)效應(yīng)。同時(shí),裂解物中二硫鍵異構(gòu)酶(PDI)與分子伴侶(如BiP)的活性不足,導(dǎo)致含多對(duì)二硫鍵的蛋白錯(cuò)誤折疊率升高40%-60%。為克服此瓶頸,需在裂解物中外源性添加重組糖基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體(如GnT-I/GnT-II/FUT8)以重構(gòu)修飾途徑,并通過優(yōu)化氧化還原電勢(shì)(Eh=-230 mV至-280 mV)改善二硫鍵形成效率。體外蛋白表達(dá)的這些修飾缺陷是目前制約其應(yīng)用于功能性糖蛋白生產(chǎn)的主要因素。
無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)(CFPS)的he xin優(yōu)勢(shì)在于其高效性、靈活性和較廣的適用性。與傳統(tǒng)細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)相比,CFPS無需繁瑣的細(xì)胞培養(yǎng)和基因轉(zhuǎn)染步驟,可在數(shù)小時(shí)內(nèi)完成蛋白質(zhì)合成,速度提升5-10倍,特別適合快速研發(fā)需求。該系統(tǒng)采用開放的反應(yīng)體系,允許直接添加非天然氨基酸、同位素標(biāo)記物或翻譯調(diào)控因子,為定制化蛋白(如抗體藥物偶聯(lián)物、熒光標(biāo)記蛋白)的合成提供了獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。此外,CFPS能夠高效表達(dá)傳統(tǒng)細(xì)胞系統(tǒng)難以生產(chǎn)的毒性蛋白、膜蛋白或易被蛋白酶降解的蛋白,解決了細(xì)胞表達(dá)中的存活率問題。由于反應(yīng)條件完全可控,研究人員可實(shí)時(shí)優(yōu)化溫度、pH和底物濃度等參數(shù),明顯提高復(fù)雜蛋白的可溶性和活性。這些特點(diǎn)使CFPS成為藥物開發(fā)、合成生物學(xué)和蛋白質(zhì)工程領(lǐng)域的重要工具,尤其適用于小批量、高難度蛋白的快速制備和篩選。大腸桿菌裂解物的??高翻譯效率??可支持??100μg/mL級(jí)??蛋白產(chǎn)量,限制造就完整功能的真核蛋白表達(dá)。
在無細(xì)胞合成生物學(xué)的框架下,可編程分子制造引擎的he xin角色可讓體外蛋白表達(dá)充當(dāng)。其模塊化特性允許研究者將生物系統(tǒng)解構(gòu)為三個(gè)可du li操作的層級(jí):信息層:DNA/mRNA模板作為信息載體,其啟動(dòng)子強(qiáng)度(如T7系統(tǒng)表達(dá)量比SP6高3倍)與5'UTR二級(jí)結(jié)構(gòu)(ΔG<-50 kJ/mol時(shí)翻譯效率銳減)可自由優(yōu)化;執(zhí)行層:裂解物中的核糖體作為分子機(jī)器,通過補(bǔ)充非天然氨基酸(如對(duì)疊氮苯丙氨酸)擴(kuò)展產(chǎn)物化學(xué)空間;調(diào)控層:添加核糖核酸開關(guān)(Riboswitch)或適配體(Aptamer)實(shí)現(xiàn)反饋控制,例如當(dāng)產(chǎn)物積累至閾值濃度時(shí)觸發(fā)終止子發(fā)卡結(jié)構(gòu)折疊終止反應(yīng)。這種分層控制使體外蛋白表達(dá)能夠驅(qū)動(dòng)人工設(shè)計(jì)基因回路的構(gòu)建,例如合成振蕩器系統(tǒng)中T7 RNA聚合酶的自抑制表達(dá)實(shí)現(xiàn)周期為120分鐘的蛋白質(zhì)濃度波動(dòng),為構(gòu)建人工細(xì)胞提供可控的時(shí)空動(dòng)態(tài)基礎(chǔ)。添加 2 mM 鎂離子可使 ??大腸桿菌體外蛋白表達(dá)??產(chǎn)量提高 60%。大腸桿菌可溶蛋白表達(dá)異常
芯片級(jí)體外蛋白表達(dá)??體現(xiàn)較前沿的進(jìn)展。目的蛋白表達(dá)水平
體外蛋白表達(dá)系統(tǒng)的明顯缺陷在于 缺乏真核細(xì)胞器結(jié)構(gòu),導(dǎo)致關(guān)鍵翻譯后修飾難以實(shí)現(xiàn):糖基化不完整性: 裂解物中缺乏高爾基體轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制,只能生成高甘露糖型等簡(jiǎn)單糖鏈,無法合成復(fù)雜雙觸角N-糖;磷酸化/乙酰化失衡: 激酶/磷酸酶網(wǎng)絡(luò)不完整,使信號(hào)通路蛋白的修飾狀態(tài)與生理?xiàng)l件差異明顯;二硫鍵錯(cuò)配風(fēng)險(xiǎn): 氧化還原環(huán)境調(diào)控不足導(dǎo)致多二硫鍵蛋白錯(cuò)誤折疊率升高。這些局限使體外蛋白表達(dá)在 zhi liao性抗體等需精確修飾的蛋白生產(chǎn)中應(yīng)用受限。目的蛋白表達(dá)水平