病毒宏基因組測序注意事項:探普生物對樣本進行宏病毒組測序實驗基于二代測序技術。經過核酸純化-文庫構建-生物信息學分析這3大基本流程后,樣本轉換成了序列數據。先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專門針對病毒的核酸純化樣本指南,以提高純度和得率,與此同時探普生物也提供核酸純化服務。第二,文庫構建環(huán)節(jié)。樣本的核酸具備濃度低,總量少的特點。探普生物專門針對這一點開發(fā)了超微量核酸文庫構建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構建成測序文庫。第三,生物信息學分析環(huán)節(jié)。寄生性質的生物下機數據一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數據。探普生物基于該特點,優(yōu)化了自有數據庫,搭載了專門用的的生物信息學分析流程,可處理復雜背景下的目標物種序列。宏基因組測序可以提供比傳統(tǒng)方法更快、更早的診斷結果,以及在的升級/降級方面具有重要意義。安徽腸道微生物多樣性分析價格
病毒宏基因組測序可直接對樣本中的核酸進行高通量測序,鑒定樣本中可能存在的病原菌,輔助臨床決策。覆蓋細菌、病毒、寄生蟲、衣原體、立克次氏體、螺旋體等13396種微生物;同時進行耐藥基因檢測,涵蓋266種耐藥菌,2984種抗性基因。宏基因組測序在新發(fā)腹瀉病毒鑒定中的應用:發(fā)現和鑒定新病毒以及確定新病毒與疾病的關系是預防、診斷和新發(fā)病毒性傳染病的首要任務。高通量測序技術突破了傳統(tǒng)技術方法的局限,可以直接以標本中所有的遺傳物質為研究對象,從而能夠快速地鑒定出標本中存在的病毒,形成了一門研究特定環(huán)境中病毒群落的新興學科:病毒宏基因組學(宏病毒組)。河南皮膚微生物分析診斷探普生物的研發(fā)團隊都是來自全國各地病毒學、微生物學專業(yè)高校的。
目前技術的進一步成熟,未來二代測序病原體檢測應進一步在成本下降、診斷標準完善、質量控制提升等方面進行完善。同時應進一步增加大樣本量的研究,以建立中國傳染病原體宏基因組學檢測的標準規(guī)范。對于懷疑神經系統(tǒng)急性傳染的患者,如有條件,推薦在抽取腦脊液時同步留取2mL腦脊液標本保存于-16~20℃冰箱。在完成常規(guī)生物化學檢查和培養(yǎng)之后,若3d內未獲得明確的病原學依據且經驗性抗傳染無效,推薦對留存的腦脊液標本進行二代測序檢測。若未留存標本,可重新采集標本(A,Ⅱ)。
探普生物對樣本進行宏病毒組測序實驗基于二代測序技術。經過核酸純化-文庫構建-生物信息學分析這3大基本流程后,樣本轉換成了序列數據。首先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專門針對病毒的核酸純化樣本指南,以提高純度和得率,與此同時探普生物也提供核酸純化服務。第二,文庫構建環(huán)節(jié)。樣本的核酸具備濃度低,總量少的特點。探普生物專門針對這一點開發(fā)了超微量核酸文庫構建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構建成測序文庫。第三,生物信息學分析環(huán)節(jié)。寄生性質的生物下機數據一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數據。探普生物基于該特點,優(yōu)化了自有數據庫,搭載了專門用的的生物信息學分析流程,可處理復雜背景下的目標物種序列。宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個微生物群落作為研究的對象,不需對微生物進行分離培養(yǎng)。
病毒宏基因組測序的研究案例:噬菌體是糞便病毒組的主要成員,糞便病毒組移植(FVT)或能有效的調節(jié)腸道菌群。在該項概念驗證試驗中發(fā)現,接受瘦小鼠的糞便病毒組移植后,飼喂高脂食物的小鼠體重增長變慢,同時還能保持正常的血糖指標,FVT引起的腸道菌群變化介導了這些保護性功能代謝作用。這項研究表明,FVT療法或能用來改善肥胖和糖尿病等腸道菌群相關代謝類疾病。對噬菌體不造成損傷,大程度保證了病毒活性,適用于下游FVT研究。宏病毒組學(ViralMetagenomics)是宏基因組學的一個分支,但與傳統(tǒng)的宏基因組學概念不同,它是在宏基因組學概念的基礎上,結合病毒自身的特點,將宏基因組學方法應用到病毒學領域而形成的。病毒宏基因組測序,樣本都會伴隨基因組數倍于病毒的細菌和宿主細胞。河南皮膚微生物分析診斷
宏基因組測序技術不依賴于微生物的分離培養(yǎng)。安徽腸道微生物多樣性分析價格
探普生物的病毒測序:由于探普生物具備處理大量多樣的病毒樣本的經驗,熟知各類病毒樣本的特性,因此對于樣本準備有獨特的方法指南,這就為后續(xù)的分析結果打下了牢固的基礎,減少了客戶和公司之間的摩擦,也幾乎沒有售后問題。獨有的實驗和分析流程可兼容高復雜度低濃度的病毒核酸。因此探普生物的病毒測序結果質量有保障外還具備:樣本準備簡單,商務流程通暢,回復消息及時,反饋處理迅速等優(yōu)點。我國經濟進入“新常態(tài)”,總體上推動["病毒測序","病毒全基因組測序","病毒宏基因組測序","未知病原鑒定"]從粗放式增長向注重質量、效率方向轉變。安徽腸道微生物多樣性分析價格