病原微生物檢測方法:病原微生物檢測方法-高通量測序技術(shù)。隨著技術(shù)飛速發(fā)展高通量測序技術(shù),又稱為新一代測序技術(shù),相對應(yīng)于以Sanger測序法為一代測序技術(shù)而得名。具有高準(zhǔn)確性、高通量、高靈敏度和低運(yùn)行成本等突出優(yōu)勢。隨著高通量測序技術(shù)的迅猛發(fā)展,科研工作者開始越來越多地應(yīng)用高通量測序技術(shù)來解決各種生物學(xué)問題。高通量測序技術(shù)在病原微生物鑒定、新病原微生物發(fā)現(xiàn)、環(huán)境中病原微生物種群鑒定、病原-寄主互作、病原流行與傳播以及病原耐藥研究方面都獲得了應(yīng)用。高通量測序技術(shù)能提供一條新的病原微生物鑒定途徑。北京未知病原微生物篩查服務(wù)公司
未知病原微生物樣本要經(jīng)歷:核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程才能完成鑒定。高通量測序技術(shù)之解決疑難鑒定問題并提高檢測的靈敏度,在病原微生物檢測與鑒定方面,對一些非典型癥狀的樣品,依靠先驗知識與傳統(tǒng)檢測方法無法有效對病原微生物進(jìn)行檢測時,高通量測序技術(shù)通過對基因組進(jìn)行全序列測序,可有效檢測出在某種材料中可能攜帶的之前未報道過的病原微生物,或鑒定出混合侵染樣品中的不同病原分離物,降低有害生物傳入的風(fēng)險。相對傳統(tǒng)的生物學(xué)、血清學(xué)與分子生物學(xué)檢測技術(shù),高通量測序技術(shù)具有更高的特異性和靈敏性,即使在樣品中病原微生物存在量較低的情況下依然能夠做出快速、準(zhǔn)確的檢測,尤其適用于病原微生物侵染初期的樣品材料的檢測。浙江未知病原檢測技術(shù)除了利用病毒的致病性定量檢測病毒外,也可應(yīng)用物理方法。
微生物鑒定相關(guān)用途:醫(yī)療保健:準(zhǔn)確、快速地鑒定細(xì)菌和寄生蟲,以進(jìn)行正確和及時的疾病診斷,并進(jìn)行適當(dāng)?shù)脑\療。流行病學(xué):為了追蹤病原體和追蹤疾病的傳播和暴發(fā),以及鑒定新的隔離物,例如耐藥隔離。制藥工業(yè):由于微生物是對無菌性的重大威脅,對環(huán)境微生物的準(zhǔn)確鑒定通常是制藥行業(yè)良好的生產(chǎn)實踐(GMP)要求。其他用途:包括刑事調(diào)查、微生物取證和環(huán)境研究等。傳統(tǒng)的微生物鑒定方法依賴于表型鑒定,主要是用染色法、培養(yǎng)法和簡單的生化檢驗。宏觀特征包括微生物的整體外觀,其形狀、大小、顏色和氣味等,可以用肉眼看到。通過在瓊脂培養(yǎng)基檢查其形態(tài)學(xué)/宏觀特征來確定微生物的類型。同一物種在不同的培養(yǎng)基中會出現(xiàn)不同的表現(xiàn)。
未知病原微生物鑒定中的傳統(tǒng)的血清學(xué)與分子生物學(xué)方法如ELISA與PCR,由于病原微生物的特異性差異,有時只能用于病原微生物特定種甚至特定種特定株系分離物的檢測;而電鏡與生物學(xué)接種鑒定方法又難以將病原微生物鑒定至物種水平。相比之下,高通量測序技術(shù)可以提供一條新的病原微生物鑒定途徑。病原微生物檢測的不可知性使得高通量測序成為研究這類病原微生物的有用工具。目前,該技術(shù)在人類與動植物病原微生物的鑒定中已經(jīng)有較多的應(yīng)用。高通量測序在臨床virology領(lǐng)域的應(yīng)用病毒作為一種古老的物種存在于自然界,幾乎能夠在任何物種寄生,與人類健康息息相關(guān)。雖然大部分病毒沒有出現(xiàn)明顯的臨床癥狀,少數(shù)病毒能夠引起人類多種疾病,表現(xiàn)出包括發(fā)熱、腹瀉、出血、出疹、呼吸道癥狀、神經(jīng)系統(tǒng)癥狀等。室內(nèi)空氣是微生物污染的傳播途徑。
我們食品微生物檢測過程中,除了我們知道要檢測的目標(biāo)微生物之外,往往會出現(xiàn)一些和目標(biāo)微生物表現(xiàn)不一,但你又想知道它是什么菌屬的情況,特別是對于一些生產(chǎn)企業(yè),有時候往往會懷疑是否是因為這個“非目標(biāo)菌”的存在,從而影響到了產(chǎn)品質(zhì)量。那怎么去鑒定那些“非目標(biāo)”微生物呢?又有哪些方法和手段可以采用呢?傳統(tǒng)的細(xì)菌系統(tǒng)分類,也就是常說的鑒定,通常是通過純培養(yǎng)分離后從形態(tài)學(xué)、生理生化反應(yīng)特征以及免疫學(xué)特性(血清學(xué)分析)進(jìn)行鑒定。這也是我們目前國標(biāo)中常用的鑒定手段,這種方法的優(yōu)點(diǎn)就是所用試劑簡單易得,常規(guī)實驗室即可展開,經(jīng)濟(jì)實用,缺點(diǎn)呢,就是鑒定所需時間較長,且容易判斷不準(zhǔn)確。用這種方法,要先進(jìn)行革蘭氏染色,從鏡檢分析其可能的微生物種屬,再根據(jù)判斷結(jié)果,按照《伯杰氏手冊》上的生化項目進(jìn)行實驗,確定其可能的微生物種屬。比如,鏡檢是革蘭氏陽性桿菌,且周圍或菌體頂端有芽孢產(chǎn)生,這時候我們就要往芽孢桿菌的方向去進(jìn)行生理生化鑒定。微生物檢測在實驗室檢測中有著重要的地位。北京未知病原微生物篩查服務(wù)公司
進(jìn)行菌種鑒定時,所用的微生物均要求為純的培養(yǎng)物。北京未知病原微生物篩查服務(wù)公司
微生物鑒定:微生物鑒定能采用不同微生物對周圍環(huán)境的資源的利用度有所不同的特性來區(qū)別。比如說微生物能否以二氧化碳作為微生物自身生長的碳源以及對糖類等物質(zhì)的需求程度來區(qū)分。亦或者說對不同類型生長因子的需求也是重點(diǎn)。其實我們還可以通過控制微生物的生長環(huán)境來判斷微生物的種屬類型。比如說該微生物生長需氧,以及適合在什么溫度進(jìn)行生長繁殖,什么溫度微生物會轉(zhuǎn)入芽孢形態(tài)進(jìn)行休眠,根據(jù)這些表現(xiàn)的不同,都可進(jìn)行微生物的的鑒別。北京未知病原微生物篩查服務(wù)公司